行送りの基準位置の違い（ワードプロセッシングとタイプセッティング）

詳しくはこちらがわかりやすいです。（InDesignの勉強部屋 No.41 ワードプロセッシング）
　　

変換するとすべて［仮想ボディの上 / 右］になります（Quarkではタイプセッティング）
変更していなければ、［仮想ボディの下 / 左］がQuarkのデフォルトです（ワードプロセッシング）

見出しなどで行送りを変えている箇所でQuarkと違ってきますので
Quarkと同じように編集したい場合には［仮想ボディの下 / 左］に変更します。